在组织的培养和自身的努力下，周林勇从拖坝中心卫生院调入甘孜县人民医院，并在短短3年多时间就晋升为县医院外妇科副主任，成为了当时医院最年轻的学科带头人，业务精干的“一把刀”，之后很快又晋升为业务副院长，40岁便担任甘孜县人民医院院长。每当遇到疑难的病情和手术，他总是冲在最前线，多次得到了病人、领导和同事的认可，办公室的锦旗和奖牌也挂满了整面墙。上任县医院“一把手”后，周林勇又积极创建二甲医院，争创了甘孜州县级医院多个“第一”，把甘孜县人民医院发展成为了康北医疗中心。